Protein–RNA interactions for Protein: J3QP01

Gm5108, Predicted gene 5108, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5108J3QP01 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5108J3QP01 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5108J3QP01 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5108J3QP01 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5108J3QP01 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5108J3QP01 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5108J3QP01 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5108J3QP01 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5108J3QP01 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5108J3QP01 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5108J3QP01 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5108J3QP01 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5108J3QP01 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5108J3QP01 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5108J3QP01 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5108J3QP01 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5108J3QP01 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5108J3QP01 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5108J3QP01 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5108J3QP01 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5108J3QP01 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5108J3QP01 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5108J3QP01 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms