Protein–RNA interactions for Protein: J3QJZ1

Gm21969, Predicted gene 21969, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21969J3QJZ1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm21969J3QJZ1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms