Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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