Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf4bG5E8Z2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4bG5E8Z2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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