Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tubgcp6G5E8P0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tubgcp6G5E8P0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms