Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U1

Obox6, Oocyte specific homeobox 6, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox6G3X9U1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox6G3X9U1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox6G3X9U1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox6G3X9U1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox6G3X9U1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox6G3X9U1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox6G3X9U1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox6G3X9U1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox6G3X9U1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox6G3X9U1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox6G3X9U1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Obox6G3X9U1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Obox6G3X9U1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Obox6G3X9U1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Obox6G3X9U1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Obox6G3X9U1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Obox6G3X9U1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Obox6G3X9U1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Obox6G3X9U1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Obox6G3X9U1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Obox6G3X9U1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Obox6G3X9U1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Obox6G3X9U1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Obox6G3X9U1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Obox6G3X9U1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Obox6G3X9U1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms