Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf148G3X9R7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf148G3X9R7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms