Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SprtnG3X912 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SprtnG3X912 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms