Protein–RNA interactions for Protein: G3UW92

Klhl33, Kelch-like 33, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl33G3UW92 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl33G3UW92 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl33G3UW92 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klhl33G3UW92 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klhl33G3UW92 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Klhl33G3UW92 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl33G3UW92 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl33G3UW92 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl33G3UW92 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl33G3UW92 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl33G3UW92 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl33G3UW92 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Klhl33G3UW92 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl33G3UW92 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl33G3UW92 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl33G3UW92 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl33G3UW92 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl33G3UW92 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl33G3UW92 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl33G3UW92 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl33G3UW92 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl33G3UW92 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl33G3UW92 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Klhl33G3UW92 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl33G3UW92 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms