Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34aG3UW52 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms