Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
5830473C10RikF8VQ07 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms