Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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