Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm28048F7BCN0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms