Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms