Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Crocc2F6XLV1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Crocc2F6XLV1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Crocc2F6XLV1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Crocc2F6XLV1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Crocc2F6XLV1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms