Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm17093F6XGJ4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms