Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

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Length 2,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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BC067074F6RXI4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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BC067074F6RXI4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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BC067074F6RXI4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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BC067074F6RXI4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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BC067074F6RXI4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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BC067074F6RXI4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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BC067074F6RXI4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC067074F6RXI4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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