Protein–RNA interactions for Protein: E9QAF4

Phldb3, Pleckstrin homology-like domain, family B, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phldb3E9QAF4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phldb3E9QAF4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phldb3E9QAF4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Phldb3E9QAF4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Phldb3E9QAF4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phldb3E9QAF4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phldb3E9QAF4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phldb3E9QAF4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phldb3E9QAF4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phldb3E9QAF4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phldb3E9QAF4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Phldb3E9QAF4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phldb3E9QAF4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phldb3E9QAF4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phldb3E9QAF4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Phldb3E9QAF4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phldb3E9QAF4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phldb3E9QAF4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Phldb3E9QAF4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Phldb3E9QAF4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Phldb3E9QAF4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phldb3E9QAF4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Phldb3E9QAF4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Phldb3E9QAF4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phldb3E9QAF4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phldb3E9QAF4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phldb3E9QAF4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phldb3E9QAF4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phldb3E9QAF4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phldb3E9QAF4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phldb3E9QAF4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phldb3E9QAF4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phldb3E9QAF4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phldb3E9QAF4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phldb3E9QAF4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phldb3E9QAF4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phldb3E9QAF4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phldb3E9QAF4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms