Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.1 ms