Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Gm5407E9Q7Q1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Gm5407E9Q7Q1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Gm5407E9Q7Q1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Gm5407E9Q7Q1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Gm5407E9Q7Q1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Gm5407E9Q7Q1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Gm5407E9Q7Q1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm5407E9Q7Q1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5407E9Q7Q1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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