Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp31E9Q6Y8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms