Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r56E9Q4U5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r56E9Q4U5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r56E9Q4U5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r56E9Q4U5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r56E9Q4U5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r56E9Q4U5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r56E9Q4U5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r56E9Q4U5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r56E9Q4U5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r56E9Q4U5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r56E9Q4U5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r56E9Q4U5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r56E9Q4U5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r56E9Q4U5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r56E9Q4U5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r56E9Q4U5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r56E9Q4U5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r56E9Q4U5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r56E9Q4U5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r56E9Q4U5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn2r56E9Q4U5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms