Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms