Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms