Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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