Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1P8

Irf2bp2, Interferon regulatory factor 2-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2bp2E9Q1P8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Irf2bp2E9Q1P8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Irf2bp2E9Q1P8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Irf2bp2E9Q1P8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Irf2bp2E9Q1P8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Irf2bp2E9Q1P8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Irf2bp2E9Q1P8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Irf2bp2E9Q1P8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Irf2bp2E9Q1P8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Irf2bp2E9Q1P8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Irf2bp2E9Q1P8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Irf2bp2E9Q1P8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Irf2bp2E9Q1P8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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