Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fndc1E9Q043 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fndc1E9Q043 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms