Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx60E9PZQ1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms