Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Scaf11E9PZM7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Scaf11E9PZM7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms