Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd2E9PZM4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms