Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rsph10bE9PYQ0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms