Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn4E9PX29 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms