Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rsf1E9PWW9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms