Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG8

9530053A07Rik, RIKEN cDNA 9530053A07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 2,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9530053A07RikE9PVG8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9530053A07RikE9PVG8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms