Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG0

Gm9008, Predicted pseudogene 9008, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9008E9PVG0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9008E9PVG0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm9008E9PVG0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm9008E9PVG0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm9008E9PVG0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm9008E9PVG0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm9008E9PVG0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm9008E9PVG0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm9008E9PVG0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm9008E9PVG0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms