Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc62E9PVD1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms