Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms