Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FgaE9PV24 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FgaE9PV24 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FgaE9PV24 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FgaE9PV24 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms