Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms