Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930444G20RikD3Z741 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
4930444G20RikD3Z741 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms