Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hfm1D3Z4R1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms