Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim12cD3Z3L3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms