Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms