Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
3425401B19RikD3Z1D3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms