Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc8D3YZV8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms