Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms