Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CatipB9EKE5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms