Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Cttnbp2B9EJA2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cttnbp2B9EJA2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Cttnbp2B9EJA2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cttnbp2B9EJA2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cttnbp2B9EJA2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cttnbp2B9EJA2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cttnbp2B9EJA2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cttnbp2B9EJA2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cttnbp2B9EJA2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cttnbp2B9EJA2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cttnbp2B9EJA2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cttnbp2B9EJA2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cttnbp2B9EJA2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cttnbp2B9EJA2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cttnbp2B9EJA2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cttnbp2B9EJA2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cttnbp2B9EJA2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cttnbp2B9EJA2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cttnbp2B9EJA2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cttnbp2B9EJA2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cttnbp2B9EJA2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms