Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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