Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phf11cB4XVP9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms